Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms