Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf271P15620 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf271P15620 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms