Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd1P13516 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd1P13516 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd1P13516 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms