Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd5P13379 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms