Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms