Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd2P13011 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd2P13011 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms