Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg5P12961 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg5P12961 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg5P12961 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms