Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms