Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk1P11440 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk1P11440 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms