Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FlgP11088 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FlgP11088 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FlgP11088 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FlgP11088 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FlgP11088 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FlgP11088 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FlgP11088 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FlgP11088 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FlgP11088 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FlgP11088 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FlgP11088 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FlgP11088 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FlgP11088 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FlgP11088 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FlgP11088 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FlgP11088 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FlgP11088 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FlgP11088 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FlgP11088 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FlgP11088 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FlgP11088 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FlgP11088 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FlgP11088 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FlgP11088 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FlgP11088 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FlgP11088 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FlgP11088 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FlgP11088 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FlgP11088 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FlgP11088 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FlgP11088 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms