Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl3P10855 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl3P10855 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl3P10855 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl3P10855 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl3P10855 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl3P10855 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl3P10855 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl3P10855 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl3P10855 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl3P10855 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms