Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nid1P10493 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nid1P10493 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nid1P10493 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nid1P10493 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nid1P10493 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nid1P10493 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nid1P10493 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms