Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms