Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3cP0DOY1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms