Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms