Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1rP09581 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Csf1rP09581 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf1rP09581 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf1rP09581 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf1rP09581 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf1rP09581 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf1rP09581 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms