Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Pde6gP09174 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pde6gP09174 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pde6gP09174 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pde6gP09174 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pde6gP09174 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pde6gP09174 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pde6gP09174 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pde6gP09174 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde6gP09174 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pde6gP09174 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pde6gP09174 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde6gP09174 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde6gP09174 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pde6gP09174 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde6gP09174 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde6gP09174 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pde6gP09174 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pde6gP09174 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pde6gP09174 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pde6gP09174 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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