Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06321 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06321 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06321 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06321 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06321 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06321 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06321 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P06321 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06321 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06321 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P06321 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06321 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P06321 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P06321 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06321 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms