Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms