Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01680 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01680 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01680 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01680 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01680 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01680 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01680 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01680 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01680 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01680 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01680 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01680 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01680 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01680 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01680 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01680 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01680 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01680 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01680 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01680 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01680 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01680 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01680 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01680 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01680 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms