Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01678 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01678 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01678 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01678 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P01678 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P01678 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01678 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01678 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01678 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01678 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01678 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01678 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01678 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
P01678 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01678 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01678 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01678 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01678 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms