Protein–RNA interactions for Protein: P01675

Ig kappa chain V-VI region XRPC 44, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01675 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01675 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01675 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01675 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01675 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P01675 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P01675 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01675 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01675 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01675 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01675 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01675 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01675 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01675 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
P01675 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01675 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01675 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01675 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01675 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms