Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01667 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01667 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01667 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01667 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01667 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01667 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01667 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01667 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01667 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01667 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01667 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01667 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01667 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01667 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01667 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01667 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms