Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01655 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01655 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01655 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01655 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01655 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01655 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01655 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01655 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01655 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01655 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01655 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01655 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01655 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01655 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms