Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01649 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01649 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01649 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01649 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01649 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms