Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
P01636 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01636 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01636 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01636 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01636 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01636 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01636 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01636 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01636 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01636 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01636 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01636 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01636 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01636 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01636 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01636 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01636 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01636 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01636 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01636 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01636 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01636 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01636 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01636 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01636 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01636 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01636 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01636 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01636 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01636 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01636 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01636 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01636 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01636 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01636 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01636 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01636 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01636 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01636 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms