Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms