Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sypl2O89104 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms