Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms