Protein–RNA interactions for Protein: O89091

Klf10, Krueppel-like factor 10, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf10O89091 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf10O89091 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf10O89091 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf10O89091 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf10O89091 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf10O89091 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf10O89091 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf10O89091 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms