Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gnpda1O88958 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms