Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F11rO88792 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F11rO88792 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F11rO88792 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
F11rO88792 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
F11rO88792 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
F11rO88792 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
F11rO88792 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
F11rO88792 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
F11rO88792 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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F11rO88792 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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F11rO88792 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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F11rO88792 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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F11rO88792 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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F11rO88792 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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