Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nme6O88425 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nme6O88425 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme6O88425 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms