Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms