Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms