Protein–RNA interactions for Protein: O88324

Cd83, CD83 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd83O88324 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd83O88324 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd83O88324 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd83O88324 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd83O88324 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd83O88324 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd83O88324 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd83O88324 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd83O88324 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd83O88324 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd83O88324 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms