Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cfdp1O88271 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms