Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1O70583 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1O70583 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1O70583 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1O70583 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms