Protein–RNA interactions for Protein: O70481

Ubr1, E3 ubiquitin-protein ligase UBR1, mousemouse

Predictions only

Length 1,757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr1O70481 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubr1O70481 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubr1O70481 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr1O70481 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr1O70481 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr1O70481 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr1O70481 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr1O70481 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr1O70481 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr1O70481 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms