Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CtssO70370 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtssO70370 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtssO70370 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtssO70370 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtssO70370 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtssO70370 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtssO70370 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CtssO70370 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtssO70370 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtssO70370 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtssO70370 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtssO70370 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtssO70370 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtssO70370 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtssO70370 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtssO70370 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtssO70370 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtssO70370 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtssO70370 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtssO70370 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms