Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lnx1O70263 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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