Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RngttO55236 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RngttO55236 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RngttO55236 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RngttO55236 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RngttO55236 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RngttO55236 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RngttO55236 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RngttO55236 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RngttO55236 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RngttO55236 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RngttO55236 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RngttO55236 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RngttO55236 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RngttO55236 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RngttO55236 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RngttO55236 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RngttO55236 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RngttO55236 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RngttO55236 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RngttO55236 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RngttO55236 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RngttO55236 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RngttO55236 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RngttO55236 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RngttO55236 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RngttO55236 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RngttO55236 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RngttO55236 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms