Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb5O55234 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms