Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms