Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms