Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms