Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1bO55017 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1bO55017 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1bO55017 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1bO55017 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1bO55017 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1bO55017 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1bO55017 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1bO55017 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1bO55017 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms