Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnip3O55003 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms