Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6bO54951 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms