Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Smarce1O54941 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms